果树分子生物学与生物技术：

（1）龙眼及百香果果实品质形成与调控机理；

（2）龙眼及百香果抗性形成的生理及分子机理。

一、开设课程：

《园艺植物育种学总论》（本科，主讲，国家级一流本科课程，福建省精品在线开放课程，福建省一流本科课程）

《普通遗传学》（本科，主讲，校级课程思政示范课程）

《园艺植物良种繁育》（本科，主讲，校级一流本科课程）

《设施植物繁育技术》（本科，主讲）

《园艺植物遗传育种大实验》（本科，主讲）

《园艺学实验Ⅱ（育种学总论）》（本科，主讲）

《果树、花卉育种专题》（硕士研究生，主讲）

《园艺植物良种繁育》（硕士研究生，参讲）

《园艺植物遗传学与生理生化》（硕士研究生，参讲）

《实验室安全与实操》（硕/博士研究生，参讲）

《园艺科学进展讨论》（博士研究生，参讲）

二、教改项目：

1、基于课程思政教育理念的《园艺植物良种繁育》教学改革与实践，福建农林大学首批优秀“课程思政”教育教学改革研究项目，主持；

2、《园艺植物良种繁育》，福建农林大学线上一流本科课程建设项目，主持；

3、《园艺植物育种学总论》，福建农林大学线上线下混合式一流本科课程建设项目，主持；

4、国家级一流本科专业建设点课程资源库试点项目，主持；

三、教改文章：

1、方庭, 曾黎辉. 面向园艺专业的园艺植物育种学总论SPOC在线课程建设.现代农业科技, 2020, 2: 240-241.

2、方庭, 彭新安, 曾黎辉. 园艺专业课程思政建设探索——以《园艺植物良种繁育》课程为例.园艺与种苗, 2020, 40(11): 47-48.

miRNA827及其靶基因DlSPS在龙眼果实蔗糖积累中的作用机制研究，国家自然科学基金青年科学基金，主持；

PeMYB114调控西番莲果皮花青苷积累的分子机制研究，福建省自然科学基金，主持；

福建农林大学科研启动费，主持；

2019年福建省三区人才项目，主持；

2020年福建省科技特派员项目，主持；

2021-2022年龙岩市科技特派员项目，主持；

百香果抗茎基腐病关键基因的挖掘及抗病机理研究，中央引导地方科技发展资金项目，参与

特色优质水果品种引进、创新与产业化开发，“十四五”福建省种业创新与产业化工程项目，参与

苹果果实糖酸性状的全基因组关联分析极其遗传网络研究，国家自然科学基金国际（地区）合作与交流项目，参与；

苹果果实酸度QTLs区域液泡膜H+-ATPase及相关调节基因的关联分析和功能研究，国家自然科学基金面上项目，参与；

苹果两个clade-III SWEETs基因在果实糖积累中的功能解析及其调节基因的鉴定，国家自然科学基金面上项目，参与。

第一作者、通讯作者（含共同）论文

1、Fang T#, Wang M#, He R#, Chen Q, He D, Chen X, Li Y, Ren R, Yu W, Zeng L. A 224-bp Indel in the Promoter of PeMYB114 Accounts for Anthocyanin Accumulation of Skin in Passion Fruit (Passiflora spp.). J Agric Food Chem. 2024. doi: 10.1021/acs.jafc.4c00839. Epub ahead of print. PMID: 38637271.(Co-first auther)

2、Li Y, Ren R, Pan R, Bao Y, Xie T, Zeng L* and Fang T*. Comparative transcriptome analysis identifies candidate genes related to sucrose accumulation in longan (Dimocarpus longan Lour.) pulp. Front. Plant Sci, 2024, 15:1379750.

3、Fang T, Rao Y, Wang M, Li Y, Liu Y, Xiong P, Zeng L. Characterization of the SWEET Gene Family in Longan (Dimocarpus longan) and the Role of DlSWEET1 in Cold Tolerance. Int. J. Mol. Sci., 2022, 23: 8914.

4、Liao L^#, Zhang W^#, Zhang B^#, Fang T^#, Wang X, Cai Y, ... & Han Y. Unraveling a genetic roadmap for improved taste in the domesticated apple. Mol Plant., 2021, 14(9):1454-1471. (Co-first auther)

5、Fang T, Peng Y, Rao Y, Li S, Zeng L. Genome-wide identification and expression analysis of sugar transporter (ST) gene family in longan (Dimocarpus longan Lour.). Plants, 2020, 9(3): 342.

6、Peng Y^#, Fang T^#, Zhang Y, Zhang M, Zeng. Genome-wide identification and expression analysis of auxin response factor (ARF) gene family in longan (Dimocarpus longan Lour.). Plants, 2020, 9(2): 221. (Co-first auther)

7、Fang T, Cai Y, Yang Q, Ogutu C, Liao L, Han Y. Analysis of sorbitol content variation in wild and cultivated apples. J Sci Food Agric., 2020, 100(1): 139-144.

8、Fang T, Zhen Q,Liao L,Owiti A,Zhao L,Korban SS, Han Y. Variation of ascorbic acid concentration in fruits of cultivated and wild apples. Food chem., 2017, 225: 132-137.

9、包雨莹, 李韵, 江文洁,  谢涛, 方庭*. 龙眼DlSWEET1基因的克隆、表达及功能分析.果树学报, 2024, 41(4): 679-689.

10、李韵, 刘昱君, 潘若云,  魏秀清, 曾黎辉*, 方庭*. 鸡蛋果SUT基因家族的鉴定及表达分析. 植物资源与环境学报, 2023, 32(3): 33-44.

合作作者论文

1、Liang F, Zhang Y, Wang X, Yang S, Fang T, Zheng S, Zeng L. Integrative mRNA and Long Noncoding RNA Analysis Reveals the Regulatory Network of Floral Bud Induction in Longan (Dimocarpus longan Lour.). Front Plant Sci. 2022, 13:923183.

2、Yu X, Ali MM, Li B, Fang T, Chen F. Transcriptome data-based identification of candidate genes involved in metabolism and accumulation of soluble sugars during fruit development in 'Huangguan' plum. J Food Biochem. 2021, 45(9):e13878.

3、Ma B, Liao L, Fang T, Peng Q, Ogutu C, Zhou H, Ma F, Han Y. A Ma10 gene encoding P-type ATPase is involved in fruit organic acid accumulation in apple. Plant Biotechnol J. 2019, 17(3):674-686.

4、Zhen Q, Fang T, Peng Q, Liao L, Zhao L, Owiti A, Han Y. Developing gene-tagged molecular markers for evaluation of genetic association of apple SWEET genes with fruit sugar accumulation. Hortic res., 2018, 5(1):14.

5、Deng X, Zhao L, Fang T, Xiong Y, Ogutu C, Yang D, Vimolmangkang S, Liu Y, Han Y. Investigation of benzylisoquinoline alkaloid biosynthetic pathway and its transcriptional regulation in lotus. Hortic Res. 2018, 5:29.

6、Sun X, Matus JT, Wong DCJ, Wang Z, Chai F, Zhang L, Fang T, Zhao L, Wang Y, Han Y, Wang Q, Li S, Liang Z, Xin H. The GARP/MYB-related grape transcription factor AQUILO improves cold tolerance and promotes the accumulation of raffinose family oligosaccharides. J Exp Bot. 2018, 69(7):1749-1764.

7、Ma B, Liao L, Peng Q, Fang T, Zhou H, Korban SS, Han Y. Reduced representation genome sequencing reveals patterns of genetic diversity and selection in apple. J Integr Plant Biol. 2017, 59(3):190-204.

8、Liao L, Fang T, Ma B, Deng X, Zhao L, Han Y. Assessment of calcium and zinc accumulation in cultivated and wild apples. J Sci Food Agric., 2017, 97(12):4258-4263.

9、Ogutu C, Fang T, Yan L, Wang L, Huang L, Wang X, ... & Han, Y. Characterization and utilization of microsatellites in the Coffea canephora genome to assess genetic association between wild species in Kenya and cultivated coffee. Tree Genet Genomes., 2016, 12(3): 54.

10、Deng X, Zhu L, Fang T, Vimolmangkang S, Yang D, Ogutu C, Liu Y, Han Y. Analysis of Isoquinoline Alkaloid Composition and Wound-Induced Variation in Nelumbo Using HPLC-MS/MS. J Agric Food Chem. 2016, 64(5):1130-6.

11、Vimolmangkang S, Zheng H, Peng Q, Jiang Q, Wang H, Fang T, Liao L, Wang L, He H, Han Y. Assessment of Sugar Components and Genes Involved in the Regulation of Sucrose Accumulation in Peach Fruit. J Agric Food Chem. 2016, 64(35):6723-9.

12、Ma B, Zhao S, Wu B, Wang D, Peng Q, Owiti A, Fang T, Liao L, Ogutu C, Korban S, Li S, Han Y. Construction of a high density linkage map and its application in the identification of QTLs for soluble sugar and organic acid components in apple. Tree Genet Genomes., 2016, 12:1.

13、Gu C, Wang L, Wang W, Zhou H, Ma B, Zheng H, Fang T, Ogutu C, Vimolmangkang S, Han Y. Copy number variation of a gene cluster encoding endopolygalacturonase mediates flesh texture and stone adhesion in peach. J Exp Bot. 2016, 67(6):1993-2005.

14、Ma B, Chen J, Zheng H, Fang T, Ogutu C, Li S, Han Y, Wu B. Comparative assessment of sugar and malic acid composition in cultivated and wild apples. Food Chem. 2015, 172:86-91.

15、于馨淼,时梦,方庭,陈发兴.李果实中两个糖转运蛋白SWEET基因克隆及表达.应用与环境生物学报, 2021, 27 (5): 1372-1381

16、梁钒,张艺勇,张梦媛,方庭,郑少泉,曾黎辉.龙眼Aux/IAA基因家族全基因组鉴定及表达分析.果树学报, 2021, 38(11): 1839-1853.

17、彭媛,张艺勇,Saquib WEHEED,方庭,曾黎辉.龙眼NF-YB转录因子DlNF-YB1、DlNF-YB10的克隆和表达分析.果树学报, 2019, 36(11): 1463-1472.

18、何锐杰,方庭,余伟军,张梦媛,饶娅,梁钒,魏秀清,曾黎辉.西番莲查尔酮合成酶（CHS）基因家族全基因组鉴定及表达模式.应用与环境生物学报，2022，28(4):1066-1075