林玉玲 教授园艺学院

研究领域：

①　园艺植物遗传资源、生物育种及其分子基础

以龙眼、香蕉等果树或多花黄精为主要研究对象，进行资源收集与调查，并利用诱变（物理诱变、化学诱变）、转基因、基因编辑、合成生物学和全基因组选择等技术创制抗逆、高产、多功能性果树新种质，目前已通过上述技术获得一系列遗传材料，并进行其生理特性和分子机理解析。

②　植物细胞全能性机制--果树单细胞如何再生为完整植株

以龙眼、香蕉体胚发生为材料，利用细胞工程、转基因、基因编辑、单细胞组学等技术研究其单细胞如何再生为完整植株的分子机制，并比较单子叶和双子叶果树再生的分子和生理差异机制。

③　合成生物学研究-植物初/次生代谢产物生产及其机制解析

以龙眼、黄精药食两用植物为研究对象，特别是以愈伤组织或悬浮细胞系为研究对象，利用组织培养、转基因、基因编辑、代谢组学和基因组学等技术，研究功能代谢产物如类黄酮、类胡萝卜素、多糖等的扩大培养、生产及其机制解析。

本科课程：

《园艺植物生物技术》、《生物学前沿》、《园艺植物组织培养》、《植物生物技术概论》

研究生课程：

《园艺植物基因组学》（硕士研究生）、《果树基因组学》（博士研究生）

先后主持国家自然科学基金、省杰出青年基金、省部级等课题多项。主持的课题主要如下：

1. 龙眼小肽miPEP319介导乙烯信号和类黄酮生物合成调控体胚早期发育的分子机制（No. 32472716），国家自然科学基金面上项目，主持，2025.1-2028.12；

2. 福建特色水果种源创新及利用子项目，主持，2023.1-2025.12；

3. pri-miRNA编码的miPEPs在龙眼体胚发生过程中的分子机制研究（No. 31672127），国家自然科学基金面上项目，主持，2017-2020；

4. dlo-miR167家族在龙眼体胚发生过程中的作用机制研究（No. 31201614），国家自然科学基金青年项目，主持，2013-2015；

5. 龙眼体胚发生过程中内源诱捕靶标(eTM)调控miRNA的机制研究（No. 2015J06004），福建省自然科学基金杰出青年项目，主持，2015-2018；

6. dlo-miR160家族在龙眼体胚发生过程中的作用机制研究(No.20123515120008)，教育部高等学校博士学科点专项科研基金（新教师类），主持，2013-2015；

7. 龙眼体胚发生过程中长链非编码RNA作用机制研究（No. 20151104），福建省新世纪人才计划，主持，2016-2018；

8. tasiRNA途径在龙眼体胚发生过程中的作用机制研究（No. JA14099），福建省教育厅中青年教师教育科研项目(杰出青年基金)，主持，2014-2016；

9. 龙眼体胚发生过程中microRNA2089的表达模式和功能研究（No. 2012J0 5042），福建省自然科学基金青年项目，主持，2012-2014；

10. lncRNA及其靶基因SAUR63/64在龙眼体胚发生早期的作用机制(2020J01543), 福建省自然科学基金面上项目主持，2020.11-2023.11;

11. tasiRNA介导的ARF3/4在龙眼体胚发生过程中的作用机制（No. xjq201405），福建农林大学杰出青年基金，主持，2014.5-2017.5

12. 福建农林大学特色园艺作物生物技术及产业化服务团队，主持，2019-2022

13. 国家自然科学基金项目：龙眼体胚发生过程中lmiRNA调控靶基因甲基化的作用机制研究(2016-2019，No.31572088, 60万元，参加)；

14. 国家自然科学基金项目：龙眼体胚发生过程中Ran家族基因的表达调控机制研究（2013-2016，No.31272149, 80万元，参加）；

15. 国家自然科学基金项目：龙眼体胚发生过程中miRNA的分离与鉴定（2011-2013，No.31071787, 33万元，参加）；

16. 国家现代农业产业体系（香蕉）专项资金(2008-2015, CARS-32-11, 340万元，参加)；

17. 省重大科技专项：农业良种选育及集约化种养技术研究与示范（2015-2018, 2015NZ-0002, 1000万元，参加）；

18. 省重大科技专项专题：福建特色园艺作物种质优异基因资源的挖掘与种质创新（2015-2018，2015NZ-0002-1，400万元，参加）；

19. 校企合作横向项目---福建道地多花黄精种质资源鉴定及优质种苗快速繁育（No.KH200373A，40万，2020.8-2022.12，主持）

20. 校企合作横向项目---北京嘉博文土壤改良剂建省南平市试验示范合作协议（No.KH200234A，3万，2020.9-2021.12，主持）

21. 校企合作横向项目---作为技术负责人参与福建金源湖生态农业有限公司2021年现代种业提升工程“福建省邵武市国家中药材（多花黄精）良种繁育基地项目”，通过福建省农业农村厅的唯一推荐，2021年获批，项目总金额2500万元。

22. 校企合作横向项目--太空诱变花梨木优良单株选育（3万，2021.12- 2024.12，主持）

23. 校企合作横向项目--绿化芒果树“绝育”调控技术（26万，2022.11.1- 2024.10.31，主持）

以第一作者或通讯作者在Plant Physiology、The Plant journal、Gigascience、Tree physiology、Horticultural Plant Journal、园艺学报和果树学报等国内外杂志发表学术论文多篇。主要论文如下（*通讯作者）：

1. Yan Chen, Dejian Xie, Xiaodong Xue, Xiangwei Ma, Mengyu Liu, Xuechen Xiao, Chunwang Lai, Xiaoping Xu, Xiaohui Chen, Yukun Chen, Zihao Zhang, Xu Xuhan, Zhongxiong Lai*, Yuling Lin*.Genome-wide Hi-C analysis reveals extensive hierarchical chromatin interactions during early somatic embryogenesis.Plant Physiology,2023, kiad348.

2. Shuting Zhang, Chen Zhu, Xueying Zhang, Mengyu Liu, Xiaodong Xue, Chunwang Lai, Xu Xuhan, Yukun Chen, Zihao Zhang, Zhongxiong Lai* and Yuling Lin*. Single‐cell RNA sequencing analysis of the embryogenic calus clarifies the spatiotemporal developmental trajectories of the early somatic embryo in Dimocarpus longan[J]. The Plant Journal, 2023. 115(5):1277-1297.

3. Xiaoping Xu, Chunyu Zhang, Xiaoqiong Xu, Roudi Cai, Qingxu Guan, Xiaohui Chen, Yukun Chen, Zihao Zhang, Xu XuHan, Yuling Lin* and Zhongxiong Lai*. Riboflavin mediates m6A modification targeted by miR408, promoting early somatic embryogenesis in longan[J]. Plant Physiology, 2023, 192(3):1799- 1820.

4. Chen Y, Ma X, Xue X, Liu M, Zhang X, Xiao X, Lai C, Zhang Z, Lai Z, Lin Y* : Genome-wide analysis of the SAUR gene family and function exploration of DlSAUR32 during early longan somatic embryogenesis. Plant Physiology and Biochemistry 2023, 195:362-374.

5. Zhang, X.; Lai, C.; Xu, L.; Guan, Q.; Zhang, S.; Chen, Y.; Zhang, Z.; Chen, Y.; Lai, Z*.; Lin, Y*., Integrated proteome and acetylome analyses provide novel insights into early somatic embryogenesis of Dimocarpus longan. Plant Physiology and Biochemistry 2023, 196, 903-916.

6. Li, Z.; Fu, Z.; Zhang, S.; Zhang, X.; Xue, X.; Chen, Y.; Zhang, Z.; Lai, Z.; Lin, Y*., Genome-wide analysis of the GLP gene family and overexpression of GLP1-5–1 to promote lignin accumulation during early somatic embryo development in Dimocarpus longan. BMC genomics 2023, 24 (1), 1-20.

7. Wang, Q.; Ban, J.; Cai, R.; Zhang, X.; Lai, C.; Chen, Y.; Li, X.; Chen, C.; Chen, Y.; Zhang, Z.,  Lai, Z*; Lin, Y*. Metabolic Composition and Quality Traits of Polygonatum cyrtonema Hua from Different Germplasms and Age Sections Based on Widely Targeted Metabolomics Analysis. International Journal of Molecular Sciences 2023, 24 (7), 6077.

8. Zhou C, Zhu C, Tian C, Xie S, Xu K, Huang L, Wen S, Zhang C, Lai Z, Lin Y*, Guo Y*: The chromosome-scale genome assembly of Jasminum sambac var. unifoliatum provides insights into the formation of floral fragrance. Horticultural Plant Journal 2023.

9. Xiangwei Ma, Yan Chen, Mengyu Liu, Xiaodong Xue, Xueying Zhang, Luzhen Xu, Zhong xiong Lai and Yuling Lin*.Genome-wide identification and expression analysis of the XTH gene family and functional analysis of DlXTH23.5/25 during the early somatic embryogenesis in longan (Dimocarpus longan Lour.). Frontiers in Plant Science.2022

10. Chen X, Xu X, Zhang S, Munir N, Zhu C, Zhang Z, Chen Y, Xuhan X, Lin Y*, Lai Z*: Genome-wide circular RNA profiling and competing endogenous RNA regulatory network analysis provide new insights into the molecular mechanisms underlying early somatic embryogenesis in Dimocarpus longan Lour. Tree physiology 2022, 42(9):1876-1898.

11. Xueying Zhang, Chunwang Lai, Mengyu Liu, Xiaodong Xue, Shuting Zhang, Yan Chen, Xuechen Xiao, Zihao Zhang, Yukun Chen, Zhongxiong Lai*, Yuling Lin*. Whole Genome Analysis of SLs pathway genes and functional characterization of DlSMXL6 in longan early somatic embryo development. International Journal of Molecular Sciences.2022

12. Lai, C W.; Zhou, X J.; Zhang, S T.; Zhang, X Y.; Liu, M Y.; Zhang C Y.; Xu, X Q.; Xu, X P.; Chen, X H.; Chen, Y.; Lin, W Z.; Lai, Z X.; Lin, Y L*. PAs Regulate Early Somatic Embryo Development by Changing the Gene Expression Level and the Hormonal Balance in Dimocarpus longan Lour. Genes 2022, 13, 317. https://doi.org/10.3390/genes13020317

13. Lin, Y†.; Chen, Y†.; Zeng, Y.; Zhang, S.; Zhang, Z.; Chen, Y.; Gong, J.; Lai, Z.*, Molecular characterization of miRNA genes and their expression in Dimocarpus longan Lour. Planta 2021, 253 (2), 41.

14. SU Li-yao†, XIAO Xue-chen†, JIANG Meng-qi, HUANG Shu-qi, XUE Xiao-dong, LI Xue, LAI Zhong-xiong, LIN Yu-ling*. 2021. Genome-wide analysis of CCCH zinc finger family in longan: characteristic identification and expression profiles in Dimocarpus longan Lour. Journal of Integrative Agriculture, doi: 10.1016/S2095-3119(20)63460-8.

15. Zhou C, Zhu C, Tian C, Xu K, Huang L, Shi B, Lai Z, Lin Y*, Guo Y*: Integrated volatile metabolome, multi-flux full-length sequencing, and transcriptome analyses provide insights into the aroma formation of postharvest jasmine (Jasminum sambac) during flowering. Postharvest Biology and Technology 2022, 183:111726.

16. Xu X, Chen X, Shen X, Chen R, Zhu C, Zhang Z, Chen Y, Lin W, Xu X, Lin Y*, Lai Z*: Genome-wide identification and characterization of DEAD-box helicase family associated with early somatic embryogenesis in Dimocarpus longan Lour. Journal of Plant Physiology 2021, 258-259:153364.

17. Chen X, Xu X, Shen X, Li H, Zhu C, Chen R, Munir N, Zhang Z, Chen Y, Xuhan X et al: Genome-wide investigation of DNA methylation dynamics reveals a critical role of DNA demethylation during the early somatic embryogenesis of Dimocarpus longan Lour. Tree physiology 2020.

18. Zhang, S., C. Zhu, Y. Lyu, Y. Chen, Z. Zhang, Z. Lai* and Y. Lin*. Genome-wide identification, molecular evolution, and expression analysis provide new insights into the APETALA2/ethylene responsive factor (AP2/ERF) superfamily in Dimocarpus longan Lour. BMC Genomics 2020, 21(1): 62.

19. Zhang, Q. L., L. Y. Su, S. T. Zhang, X. P. Xu, X. H. Chen, X. Li, M. Q. Jiang, S. Q. Huang, Y. K. Chen, Z. H. Zhang, Z. X. Lai and Y. L. Lin* (2020). Analyses of microRNA166 gene structure, expression, and function during the early stage of somatic embryogenesis in Dimocarpus longan Lour. Plant Physiology and Biochemistry 147: 205-214.

20. Chen, Y., X. Xu, Z. Liu, Z. Zhang, X. XuHan, Y. Lin* and Z. Lai *. Global scale transcriptome analysis reveals differentially expressed genes involve in early somatic embryogenesis in Dimocarpus longan Lour. BMC Genomics 2020 21(1): 4.

21. Li X, Chen Y, Zhang S, Su L, Xu X, Chen X, Lai Z, Lin Y*: Genome-wide identification and expression analyses of Sm genes reveal their involvement in early somatic embryogenesis in Dimocarpus longan Lour. PLoS One 2020, 15(4):e0230795.

22. Xu X, Chen X, Chen Y, Zhang Q, Su L, Chen X, Chen Y, Zhang Z, Lin Y*, Lai Z*: Genome-wide identification of miRNAs and their targets during early somatic embryogenesis in Dimocarpus longan Lour. Scientific reports 2020, 10(1):4626.

23. Chen, Y., X. Li, L. Su, X. Chen, S. Zhang, X. Xu, Z. Zhang, Y. Chen, X.XuHan, Y. Lin* and Z. Lai* (2018). Genome-wide identification and characterization of long non-coding RNAs involved in the early somatic embryogenesis in Dimocarpus longan Lour. BMC Genomics 19(1): 805.

24. 张清林, 苏立遥, 厉雪, 张舒婷, 徐小萍, 陈晓慧, 王培育, 李蓉, 张梓浩, 陈裕坤, 赖钟雄* &林玉玲* (2018). 龙眼体胚发生早期miR166初级体的克隆与表达分析. 园艺学报, 45(08), 1501-1512.

25. Lin, Y., J. Min, R. Lai, Z. Wu, Y. Chen, L. Yu, C. Cheng, Y. Jin, Q. Tian, Q. Liu, W. Liu, C. Zhang, L. Lin, Y. Hu, D. Zhang, M. Thu, Z. Zhang, S. Liu, C. Zhong, X. Fang, J. Wang, H. Yang, R. K. Varshney, Y. Yin & Z. Lai*(2017) Genome-wide sequencing of longan (Dimocarpus longan Lour.) provides insights into molecular basis of its polyphenol-rich characteristics. GigaScience, 6, 1-14.  (共同第一作者)

26. 林玉玲, 张清林, 曾友竞, 陈晓慧, 张梓浩, 陈裕坤 & 赖钟雄* (2017) 龙眼miR166家族的分子进化特性及时空表达分析. 园艺学报, 2285-2295.

27. Lin, Y., L. Lin, R. Lai, W. Liu, Y. Chen, Z. Zhang, X. Xu & Z. Lai* (2015) MicroRNA390-directed TAS3 cleavage leads to the production of tasiRNA- ARF3/4 during somatic embryogenesis in Dimocarpus longan Lour. Frontiers in Plant Science, 6.  

28. Lin Y., Z. Lai*, Q. Tian, L.Lin, R. Lai, M. Yang, D. Zhang, Y. Chen & Z. Zhang (2015) Endogenous target mimics down-regulate miR160 mediation of ARF10, -16 and -17 cleavage during somatic embryogenesis in Dimocarpus longan Lour. Frontiers in Plant Science, 6. 

29. Lin, Y., Z. Lai*, L. Lin, R. Lai, Q. Tian, W. Ye, D. Zhang, M. Yang, Y. Chen & Z. Zhang (2015) Endogenous target mimics, microRNA167, and its targets ARF6 and ARF8 during somatic embryo development in Dimocarpus longan Lour. Molecular Breeding, 35, 1-15.  

30. Lai, Z*. & Y. Lin (2013) Analysis of the global transcriptome of longan (Dimocarpus longan Lour.) embryogenic callus using Illumina paired-end sequencing. BMC Genomics, 14, 561.（共同第一作者）

31. Lin, Y.L. & Lai Z.X*. (2013) Superoxide dismutase multigene family in longan somatic embryos: a comparison of CuZn-SOD, Fe-SOD, and Mn-SOD gene structure, splicing, phylogeny, and expression. Molecular Breeding, 32, 595-615.  

32. Lin, Y. & Z. Lai* (2013) Comparative analysis reveals dynamic changes in miRNAs and their targets and expression during somatic embryogenesis in longan (Dimocarpus longan Lour.). PLoS One, 8, e60337. 

33. Lin, Y. L. & Z. X. Lai* (2013) Evaluation of suitable reference genes for normalization of microRNA expression by real-time reverse transcription PCR analysis during longan somatic embryogenesis. Plant Physiol Biochem, 66, 20-5. 

34. 林玉玲，赖钟雄*(2012)龙眼胚性愈伤组织Cu/Zn-SOD分子伴侣基因CCS的克隆及其在体胚发生过程中的表达分析，应用与环境生物学报，18(3): 351-358 

35. 林玉玲，赖钟雄*( 2012)龙眼胚性愈伤组织miR398b前体克隆及其在龙眼体胚发生过程中的表达分析,热带作物学报，33(11):2012-2017

36. 林玉玲，赖钟雄* ( 2011)龙眼胚性愈伤组织miR398a前体的克隆及其在龙眼体胚发生过程中的表达分析,热带作物学报，32(4):632-639

37. Lin, Y. L. & Z. X. Lai* (2010) Reference gene selection for qPCR analysis during somatic embryogenesis in longan tree. Plant Science, 178, 359-365.

38. Y.L. Lin and Z.X. Lai* (2010)Analyses on activities and isozymatic patterns of SOD during early somatic embryogenesis in longan. Acta Hoticulturae, 863:169-174

获奖情况：

2024年 “舜宇”杯第九届全国大学生生命科学竞赛二等奖指导教师

2024年 第十三届“挑战杯”福建省大学生创业计划竞赛银奖指导教师

2024年“威明怀”第九届全国大学生生命科学竟赛(科学探究类)福建省赛决赛一等奖指导教师

2022年度国际基因工程机器大赛iGEM银奖指导教师

2022年度挑战杯第十七届全国大学生课外学术科技作品竞赛铜奖指导教师

2022年挑战杯第十五届福建省大学生课外学术科技作品竞赛银奖指导教师

2022年度全国大学生生命科学竞赛获福建赛区“三等奖”指导教师

2020年度第十四届福建省自然科学优秀学术论文二等奖

2018年度第十三届福建省自然科学优秀学术论文一等奖；

2016年度第十二届福建省自然科学优秀学术论文三等奖；

2013年度福建省优秀博士学位论文二等奖；

2012年度第十届福建省自然科学优秀学术论文一等奖；

2012年度教师课堂教学质量综合评价绩效一等奖；

2011-2012、2012-2013、2013-2014年度学院“最佳一节课”二等奖

教学教改：

1. 荣获2022 年福建农林大学研究生类教学成果奖二等奖（排名第三）；

2. 福建农林大学《园艺植物生物技术与遗传资源科研育人导师团队》”（排名第 2）科研育人突出贡献奖三等奖；

3. 参编科学出版社出版的《热带植物组织培养》;中国三峡出版社农业科教出版中心《枇杷良种及栽培关键技术》；

4. 主持教育部产学合作协同项目1项，参加省级教改项目2项；主持校级教改项目3项；

5. 共同指导省优硕优博各1篇，指导校级优秀毕业论文3篇，2篇硕士论文和1篇本科毕业论文；

6. 指导省级大学生创新创业训练计划项目3项，校级大学生创新性计划项目3项。